ワークショップ

Photosystemをはじめとする光合成蛋白質の多くは，Ｘ線結晶解析により詳細な構造情報が提供されています．しかし，結晶学的な取り扱いや分子構造を表示するソフトに慣れていないため，専門家以外には依然として敷居が高いという声も聞きます．今回は，BioKids Wiki（http://biokids.org）というサイトを運営しておられる構造生物学の専門家にお越し頂き，構造表示ソフトPyMolの利用について初心者向けに講習して頂きます．

プログラム：
13:00-13:10 趣旨説明（高橋裕一郎）
13:10-14:00 PDBの特徴とＸ線構造について簡単な説明（栗栖源嗣）
14:00-15:15 PyMolインストール，検索（岡崎伸生）
休憩
15:45-17:00 表示，動画，ppt作成などなど（岡崎伸生）
17:00-17:30 質問コーナー

ラップトップPCを各自お持ち下さい．ただしOSをWindows10とMacOS10.12に限定させて頂きます．

特に参加申し込みの必要はありません。セミナーの内容については、http://www.photosynthesis.jp/biologyseminar5.html をご覧ください。セミナー室、実験室とも、小さい部屋ですので、参加者が多い場合にはご迷惑をおかけすることになるかもしれませんが、ご容赦いただければと思います。また、早稲田大学植物生理学研究室は、新学術領域研究「新光合成」の光合成解析センターの一部として、必要な方に各種光合成解析装置による光合成測定のサポートを行う予定にしております。どのような解析装置があり、何を測定できるのかなどを見学していただくことも可能です。皆様の参加をお待ちしております。

お問い合わせ・参加ご希望の方は、園池公毅（sonoike@waseda.jpp）までメールで申し込み下さい。

「ジョリオ型分光光度計で光合成のどんな活性を測定できるか」

日時：2015年5月23日（土）15:00 〜23日（土）12：00

第6回日本光合成学会年会の終了後に、引き続き岡山大学へ場所を移して「ジョリオ型分光光度計」の原理および使用法に関するワークショップを開催します。23日のみの参加も可能です。2006年以来の久しぶりのワークショップ開催となりますが、奮ってご参加下さい。

レクチャー (5月23日:15:00〜17:00)

• １. ジョリオ型分光光度計の原理　高橋裕一郎（岡山大）
• ２. カロテノイドシフトの測定法　高橋拓子（埼玉大）
• ３．P700の測定法　小澤真一郎（岡山大）
• ４．蛍光測定法　高橋拓子（埼玉大

ワークショップ１ ジョリオ型分光光度計の操作の基本 (17:00-18:00)

夕食を兼ねた懇親会 (19:00〜21:00)

ワークショップ２ ジョリオ型分光光度計で光合成活性を測定してみよう (5月24日:9:30〜12:00)

• １. 藻類の細胞および植物の葉のP700とカロテノイドシフトの測定）

お問い合わせ・参加ご希望の方は、高橋裕一郎（taka@cc.okayama-u.ac.jp）までメールで申し込み下さい。 希望者が多い場合は先着順としますのであらかじめご了承下さい。 ワークショップ参加者には、岡山大学・津島宿泊所（1泊2600円程度、食事なし）の紹介を致しますので、ご希望の方はお知らせ下さい。
メール件名：「第6回光合成学会ワークショップ申込」
申込締め切り日：5月7日（木）

　今回のワークショップでは、葉のつけ方の異なる単子葉植物と双子葉植物を育てて作った2種類の叢を用意しました。異なる叢が作り出す光環境の変化を測定し、それぞれの叢をつくる個々の植物の葉のつけ方と対応づけていただきます。また、光合成速度やクロロフィル蛍光などの測定も行っていただき、それぞれの植物が作りかえた光環境にどのように対応しているかも検討していただきます。この時期の維管束植物はものすごい勢いで光合成を行っています。皆さんが研究されている「光合成」が、野外でどの様に行われているか、ぜひ一度体験していただければと思います。

日程　（９月２日（金））

日程　（９月３日（土））

　遺伝子操作や、新型光合成の発見などで、多様な光合成評 価法が求められています。先端機器を使うin vivo 測定の体験ワークショップを行います。　「装置はないが、体験したい。手近の装置を使いたい、一度見たい、何がで きるか知りたい、試しに測りたい」などを想定しています。

デモと実習を通じて，バイオインフォマティクスの基礎を広く修得していただくことを目的とします。この種の本やセミナーもたくさんありますが，特に光合成研究に的を絞って，実際に使うであろうツールを重点的に紹介するように考えています。また，この分野にはマック使いの方が多いので，Mac OS XをUNIXマシンとして活用する方法について重点的に話をするように考えています。しかし，ウィンドウズを使う方も，同じようにできるよう，考慮していますので，ふるってご参加お願いします。

　DNAアレイを用いた網羅的な遺伝子発現の解析手法は、近年、比較的容易 になってきました。新しい手法を用いることで、光合成研究をはじめ広く光合成生物 の遺伝子機能研究にインパクトを与えつつあります。そこで、以下の内容で、約２０ 名程度の小規模なワークショップを企画しました。今回は、DNAアレイの利用を予定 している方や、DNAアレイを手に入れたが、実験方法に疑問をお持ちの方など初心者 を対象として、ワークショップを計画しています。

• （１）DNAアレイで何ができるのか。実験例と実験上の「ポイント」の紹介
• （２）DNAアレイのデータ解釈について「ポイント」を紹介
• （３）データ処理用ソフトウエアの紹介と体験コーナー
アレイデータの実例をも とに、データ処理のプロセスを体験していただく予定です。使用プログラムは、 Imagene, ArrayVisionなどを予定。

講演者

• 基礎生物学研究所　鈴木石根　　シアノバクテリアのDNAマイクロアレイ
• 東京大学　　　　　池内昌彦　　シアノバクテリアのDNAマイクロアレイ
• 理化学研究所　　　関　原明　　アラビドプシスのDNAマイクロアレイ
• 名古屋大学　　　　九町健一　　オリゴDNAアレイ
• 京都大学　　　　　福澤秀哉　　クラミドモナスのDNAマクロアレイ

内容：パルス変調を用いた蛍光測定は、近年発達した手法です。光化学系IIの最大量子収率、電子伝達の量子収率、エネルギーの熱放散の効率などを簡便に測定できるため、急速に使用例が増えています。また、植物体の葉をそのまま非破壊的に測定できること、海水中のプランクトンの光合成活性をそのまま測定できることなどから、野外での測定などにも応用例が広まり、さまざまな解析方法が発達してきました。 一方、測定自体は「ボタンを押すだけ」に近く簡単であるにもかかわらず、その原理は十分に理解されているとは言えず、測定はしてみたもののデータの解釈がわからない、などという声も聞きます。そこで、本ワークショップでは、簡単な原理の解説と、測定機器を使っての実際の測定によって、パルス変調法を研究の上で使いこなせるようになることを目的とします。

　簡単な蛍光測定の原理の説明、実際の機械を使ってのデモンストレーションです。今回は、あくまで初心者向けです。装置の購入を現在考えている方、または装置を購入したけれども、使い方に疑問をお持ちの方を対象とします。

使用機種：
　Waltz社　PAM 101/102/103 (Old PAM)：　生葉での測定用
　　　　　　　高感度測定ユニット：　藻類、シアノバクテリア、チラコイド膜の測定用
　　　　　　　キセノンPAM：　ポンプ＆プローブ測定用
　　　　　　　二波長P-700測定ユニット：　P-700測定用
　　　　　　　　など
　PSI社　二重変調蛍光光度計：　ＱＡ再酸化キネティクス測定用
　　　　　　二次元蛍光イメージングシステム：　変異株のスクリーニング用
　Licor社　LI-6400Fクロロフィル蛍光・光合成蒸散測定システム
　Hansatech社　クロロフィル蛍光測定システム