RNAブロット法

RNAブロット法[RNA blotting] †

　 RNAのサイズと量を測定する分析法の一つ．細胞から抽出した全RNAまたはポリ(A)+RNAをゲル電気泳動によりサイズに従って分画した上で，ナイロンなどを素材とする多孔質のフィルター膜上に転写・固定化する．これをブロットと表現する．この膜を適当な反応液中で，放射性核種またはDIG (digoxygenin)などでラベルされたプローブDNA(RNAプローブも使われる)とともに保温し，ハイブリダイゼーションを行う．その後，適当な塩濃度の洗浄液で洗って，過剰なプローブを除去し，結合したプローブをX線フィルムなどに感光させて検出する．基本的に，プローブと反応するRNAの量を測定するために用いられる．予めRNA試料をグリオキサールなどによって処理して変性させてから電気泳動を行えば，RNAがそのサイズに従って分離するため，ハイブリダイゼーションの結果，目的のmRNAのサイズ(分子量)がわかるので，ポリシストロニックな転写産物などを確認するのに有効である．DNAプロット法がSouthernによって始められたのに対して，Northernプロット法と，ニックネームで呼ばれることもある．

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