菌根のうち,宿主植物の細胞の内部まで侵入するタイプの総称.VA菌根(アーバスキュラー菌根),エリコイド(ツツジ型)菌根,アーブトイド菌根,シャクジョウソウ型菌根,ラン型菌根があるが,これらの菌根の間には必ずしも系統的な類縁性はない.VA菌根はシダ植物から木本植物に至る様々な植物と共生し,リンの吸収を促進する.他の4タイプの菌根は,特定のグループの宿主のみにみられ,その機能は様々である.