色素体には,色素体ゲノムの遺伝子を転写する2種類のRNAポリメラーゼが局在している.このうち1種は色素体ゲノムにコードされているため, PEP (plastid-encoded plastid RNA poly-merase)と呼ばれ,もう1種は核ゲノムにコードされているため, NEP (nuclear-encoded plastid RNApolymerase)と呼ばれる.