カロテノイドの一種.渦鞭毛植物のみがもつ特異な構造のカロテノイド.他の系統群では存在が知られていない.他のカロテノイドが炭素数40の化合物であるのに対して,C-12’,13’,20’が欠失した炭素数37のカロテノイドである.トレーサー実験ではゼアキサンチンがネオキサンチンを経てペリジニンに変化した.水溶性のペリジニン-クロロフィルaタンパク質複合体(PCP)は三量体構造を取り,単量体には8分子のペリジニンと2分子のクロロフィルaが結合している.このカロテノイドからクロロフィルaへの励起エネルギー移動効率はほぼ100%ときわめて高いことが知られている.このエネルギー移動過程はフェムト秒分光法によって解明されており,ペリジニンの禁制の第一励起準位からクロロフィルaの許容の第一励起準位へ起こることが示された.